王恭厂位于皇城西南隅，原来因为有火药局在这里，环境不是很好，现在火药局造到城外，这地方立即成为宜居之地。朱由校自己亲自做规划，按照后世的样子，先划出主路，然后在主路旁边划出住宅区，教学区，配套小商业区，绿化区。其它的具体问题他就无能为力了，只是强调路必须用水泥，然后楼房统一建成三层。
主管的人是魏忠贤的好兄弟魏朝，此人当年是王安手下，一直和魏忠贤关系极好，魏忠贤对朱由校说：“魏朝这人其他的不好说，但是人不贪心，如果圣上用他的话，王恭厂的账目奴婢倒是可以保证清清楚楚。”
魏朝一上位，首先就给了朱由校一个惊喜。他在外面转了一圈后，向皇帝提出，砖瓦沙石什么的其实可以不用钱的，外面大把的商人想免费供应，只需要能让他们在周报上打广告就行，朱由校想不到这个时代的人广告意识竟然如此之强，于是交代他与王承恩接洽。
于是周报上就出现了皇家专用砖厂，瓦厂，沙石厂的广告，而魏朝则只用了原价的十分之一取得了大量的原材料，这还是朱由校反复强调不能白用的结果，按商人的意思本来是不要钱的。
而至于人工，魏朝在登莱招募了大量的辽民，在内宫监工匠的指导下，开始进行王恭厂的建设。朱由校吩咐要给工钱，然后饭要让人吃饱，不要苛待辽人。
有钱有人，那么基础建设就很容易了。王恭厂的清理进行得很顺利，一个多月后，朱由校看到的是一大片平整的空地，以及空地中间横平竖直的水泥大道，大为满意，狠狠地表扬了魏朝一番，并允诺如果王恭厂能按质按量地完成建设过程，就会准许他从宗族中过继一子以承香火，把个魏朝激动得干劲冲天，发誓一定要把王恭厂的学校和住宅区建设得比皇上要求的更完美。
在朱由校的提示下，魏朝与孙元化合作，制造出了以滑轮组为主要部件的吊装工具龙门吊，使得建设时的效率大大提高。而魏朝又招收了大量的泥瓦匠，木匠，石匠组成了一个皇家建筑队。
皇家建筑队里安排了识字的太监，由他们负责进行调配，进行统筹安排，力求让每个人都能发挥最大的作用。并让大家熟悉龙门吊的使用方法，熟悉水泥的性能和混凝土的制作方法。
这样等到皇家建筑队进入王恭厂建设场地后，很快就以其速度震惊了各个行会的老工匠。工地上的每一个人都能找到自己的位置，明了自己的责任，根本没有窝工的现象出现，而水泥的出现，使得很多以前根本不可能出现的建筑样式也成为可能。
当第一幢使用了水泥的三层楼建成后，朱由校前来视查，首先看到整幢房子是砖墙结构，而楼板用的是厚木板，朱由校其实觉得最好是用混凝土楼板，但现在不可能把宝贵的钢铁用在这里，再说木楼板也有它的优点，所以也觉得挺好的。
朱由校对学校建筑提的要求就是结实好用，而对住宅区提的要求是精致。在他的设想中，大学城里是有学生宿舍的，所以外面的住宅区是要卖给京师里的有钱人的，当然是怎么豪华怎么来。