朝中反对朝廷开银行和造币厂的大臣们四处放风，认为朝廷发行银币，就是想用它来换民间的白银，银币中只有八成的银子，所以号召大家抵制新币，朝廷一发了饷，就将银币换成白银，一分总比两成要少得多。左光斗更是公然讽刺道：“今上搂钱的法子，可真是强爷胜祖呀。”
很多人听信了这种说法，大家都准备将银币换成银子，魏忠贤将东厂调查的情况报了上来。朱由校听完后淡淡地说道：“不要管他，总有他们后悔的时候的。”
银行开业两天，门口鸟都没有一只，因为新式钱币根本还没有出来。十日开饷后，大量的人涌进银行，要用银币和铜币换白银。银行里先跑出一队锦衣卫，让人按顺序排好队，不听的就是一棍打翻，然后逐出大门。大量的官平银堆在柜台上，只要交手续费即可兑换。
十日一天，基本上将官员俸禄所发银币的九成又收了回来，十二日，皇帝下旨：日后北直隶赋税收取，军饷发放，皆可以用银币和铜币。京师分行将于北直隶每县设一支行，专管钱币兑换。钱币兑换收取手续费降为一厘（千分之一），白银换银币依然免费。
换了银子回来的官员后悔也已经迟了，虽然俸禄不多，但一下子减少了百分之一，心里还是很痛的呀。
经过这么一波，新币迅速地在京师流行起来，既然可以用来交税，那当然就没问题哟，特别是新币样式精美，还不用象银子一样因为成色而被人骗，傻子才会不用新币呢。至于原来说的八成银的问题，根本就没有人在意，能交税就是最大的保障。左光斗已经请了病假，因为实在是没脸见人呀。
十一月八日，大明皇家银行南京分行成立，同时南直隶各县均有支行成立，同时皇帝下旨：南直隶赋税收取，皆可用新币。官饷军饷发放，均只能用新币。南北直隶各级税务机构所收取税款都存入大明皇家银行。银行兑换手续费均降为一毫（万分之一），白银换新币如超过十两银亦要收费。
手续费的变化是朱由校制定的，他觉得先让人上一个当，应该能加深记忆，然后逐渐减少，至于为什么不甚至变为不收手续费呢？还有白银换银币也要收费呢？朱由校是这样回答李之藻的：“朕是怕有人闲着没事干，天天换来换去，你们就不用做其它事了。”
另外，银行新增了两项业务：存储和放贷银两。一两起存，不论银两多少，均可存在银行中，不收取费用。一次存取最少要间隔一个月，十两以上白银如果想换成银币，则存储三个月后可免除手续费兑换。
至于放贷，则规定极其严格。需要有抵押，有保人，息钱可以分月或者分十天一计，十天就是一分（百分之一），一月就是三分，一年结算，一年之内，利息不重复计息，超过一年，则前一年的利息作为本金来计算。
第一项业务，几乎没有人来办理，而第二项业务则是差点将银行的门挤破。一年借贷利息不过三成六到三成九，而且没有利滚利，这和钱庄比起来简直是在做慈善，所以大量的商人或者是家有急事的人都想来借贷。不过朱由校交待过李之藻，这项业务最重要的是稳妥，一定要先做好抵押物的评估，从户部来的老吏发挥了极其重要的作用，每天忙得象陀螺一样，不过脸上的笑容却也是越来越灿烂，因为银行规定，每一笔借贷安全还款后他们都有一份评估金可拿的。不过客户的红包他们倒是不敢收的，收了也不敢乱来，因为银行还有规定，如果借贷不能还款后又发现抵押物不合评估数的，那都是要他们自己掏腰包赔的。