seele原教义派是不会放弃的，毕竟融合是他们追求的终极幸福。杜兰可以放过他们，但他们不会放过地球。
为了能够完成冲击，他们是在末日里努力发展技术，克服了s2机关的难关之后，他们制造的量产eva已经全不需要电源线了，全是半永动机的机体。加上傀儡系统，所有的机体都可以无人驾驶。
这才是未来，这才是先进，躲在基地里就能远程操控战斗，就能远程操控融合，根本不用亲自上前线。碇真嗣是没赶上好时候，要是他再晚点加入神经元，到时候就没驾驶员什么事情了。
有了s2机关，有了无人驾驶系统，那么接下来的事情就是用无人机恢复联络，准备再次重启冲击。
第一次冲击是使徒沉睡，人类为王。第二次冲击净化了海洋，第三次冲击应该净化陆地，第四次冲击就应该净化灵魂了，到时候所有人的灵魂都会融合进入黑之月，所有人都能幸福。
有了技术，末日也不算是什么，现在重要的还是要完成冲击。顺便联络渚薰，让他回归正轨，进入中央教条。
至于使徒已经不重要了，有了无人驾驶的eva，使徒已经是明日黄花，不成问题。
使徒也是惨，被第一次冲击砸晕，好不容易被第二次冲击唤醒，吸收了能量来找黑之月融合，却被人类给挡住了。明明使徒都很厉害，要是打配合就没有人类什么事情了，他们偏偏喜欢一个个送。
还说人类的心之壁呢，使徒的心之壁也很厚。他们根本就不互相信任。
无人机冲上宇宙恢复通讯，同时发现了第三新东京市已经消失了，只留下一个被雪覆盖的坑洞。力天使的破坏力确实惊人，不过可以确定黑之月并没有消失，还在地下。那么接下来的事情就好办了，消灭剩余使徒，然后融合。
当大家看到从上空掠过的无人eva的时候，神经元的人就知道这肯定是seele来了。
碇源堂就知道他们不会放弃的，可惜自己的篡夺计划已经没法进行了，因为绫波丽已经背叛了自己，妻子也已经进入了宇宙，自己就算篡夺了融合，也无法达成目的。
无人eva在坑洞上空集结，准备打穿中央教条。在神经元的下方还有巨大的地下空间，莉莉丝的本体就在其中，被固定在十字架上，同时地下就是巨大的黑之月，大小和月球差不多，这么巨大的球体一旦离开地下，就会在地壳上撕开一个巨大的口子，就好像挤爆了青春痘一样。
先要进入中央教条，然后通过莉莉丝激活黑之月，就可以开始融合了，大家一起愉快地变成橙汁。
seele准备用渚薰激活莉莉丝，而碇源堂准备用绫波丽克隆激活。
不过不管渚薰还是绫波丽，最后都会把主导权交给碇真嗣，就说气不气吧。碇源堂和seele苦心孤诣准备的大戏却被什么都没搞清楚的少年给夺取了。而少年的决定就是不断重启时间线，可惜并没有完美的结局。
渚薰和绫波丽都被碇真嗣攻略了，这位十四岁的少年用自己的温柔和善良在不知不觉中就干扰了他们。当然了也有可能是渚薰和绫波丽都是少年的性格，所以不喜欢大人的阴谋，所以宁愿帮助碇真嗣这个同龄人。相比大人的狡猾，碇真嗣就坦诚很多了，至少他是真心对待朋友的，不会和大人一样成天勾心斗角。