1月8日，星期一，下午，帝丹小学。
光彦和元太在走廊上追逐的时候撞上了一个胡子拉碴的大叔，元太被撞倒在了地上，而那个大叔一句话也没有说，就匆匆忙忙的跑了。
“没事吧，元太？”
“这人真没礼貌，撞到人居然都不道歉。”
“以前没见过他，应该不会是新老师吧？”
元太和光彦说话间，发现远处有人围观什么事情，立刻跑去看热闹，得知原来是生物室的一块珍贵的石头被偷。
元太兴奋起来了，“光彦，刚才那个大叔啊。”
“啊？”
“你还没明白过来啊？他一定就是偷走石头的人。”
“真的会是这样吗？”光彦深感怀疑，因为再怎么说，这里也是上学时间啊，门卫不会让人随随便便的进来。
“一定没错，所以他才要慌张地逃跑。”元太把光彦拉走了，“少年侦探团出发！”……
另一边，步美带着柯南找到了1年级a班，图书的卡片上，最后一个借书的人是这个班上的内藤司。
步美随便找了女生问了一下，得知内藤司没有来，好像连假都没请。
不过，女生见过内藤司在看这本冒险书，放学了以后还在看。
没有线索，步美不依不饶的决定去内藤司家去看看，地址就在通讯录上。
柯南觉得头都大了，无精打采的跟在后面。
走廊上的喧闹，引起了两人注意，看许多同学和老师在围观，其中还有小林老师，两人跑了过去。
柯南问道：“出了什么事情，小林老师？”
小林老师担心道：“事情是这样的，学校向米花博物馆借的展览品再来石被人偷走了，那可是从小行星上带回地球的珍贵标本呢。”
“哇，从宇宙中来到地球的再来石，”步美笑道，“跟这本书里的宝物一样呢，肯定也有神奇的能力吧。”
“没有那种事情啦。”小林老师苦笑道。
柯南看着现场，那砸陈列柜玻璃取物，一点也不专业的手法，心中一动，“步美，让我看看你的这本书。”
“给。”步美递上。
柯南翻了一下，书中是说，一个叫亚雷库的男孩，有一天他的宝贝口琴不见了，他就跑去问知识渊博的海龟先生，海龟先生告诉他，如果能找到再来石，就能把失去的东西找回来，要找到这块石头，必须拥有善良的心和勇气。
亚雷库很努力，终于找到了再来石，最后他把再来石高举向天空，丢失了的口琴就从天上缓缓落下了。
小林老师在柯南翻看的时候也看到了，意识到一个问题，哭笑不得，“难道说有人……”
“很难说。”柯南说道，“老师，我们要出去一下。”
小林老师很意外，“已经知道是谁了吗？”
“也许。”柯南点头道。
小林老师说道：“那我陪你们去好了。”
柯南说道：“没事的，我们是去1年级a班的同学家。”
“是内藤司同学，就在附近，他家开了一个小店，叫做内藤烧鸟。”
步美不太明白小林老师和柯南在说什么，不过这个听懂了，所以做了补充。
柯南说道：“还有，老师这样的大人过去的话，那孩子会不自在的。”
“说的也是，那好吧，你们路上小心。”小林答应了，不过心里冒出另一个念头，像侦探一样跟踪保护。……
另一边，元太和光彦追着那个胡子拉碴的大叔，一路到内藤烧鸟。
两人凑头在门缝处观望，结果被发现了。
两人吓得想跑，却被邀请了。
“你们是小司的朋友吗？进来吧。”……
不久之后，柯南和步美找来了，看到伏案大嚼的元太和光彦，两人有点傻眼，而元太和光彦也是同样。
内藤老板说道：“你们也是小司的朋友吗？进来吧，尝尝我家的烧鸟。”
柯南问道：“叔叔，关于小司没去学校的事老师联系过你吧？”
内藤老板没说话，元太和光彦两人插嘴，说了在学校撞见他，然后跟来的事情。
柯南说道：“就是说，叔叔你也不知道小司去哪里了？”
光彦问道：“叔叔，你就不担心他吗？”
内藤老板怒目相视，光彦吓得冒冷汗，不过仍然强撑住了：“虽然是我们误解你才跟踪到这里，又在这里大吃大喝的，但知道实情后那就是另一回事了。”
内藤老板声音低沉，“很快就要开门了，我可是很忙的。”
步美问道：“那阿姨不来帮忙吗？”
元太笑道：“我们家的小酒馆，可是全家上阵哦。”
“这和你们无关！”内藤老板发脾气的大喝道。
元太、步美、光彦都吓得不敢说话了，柯南却不在乎，“叔叔，可以让我们去小司的房间看看吗？可能会找到些线索，叔叔你也很担心小司的，不是吗？”
内藤老板扫视四人，然后低头继续干活，不过嘴上说道：“你们自己去吧，就在后面，从那边的侧门。”
“谢谢大叔，我们一定会找到小司的。”柯南带头撤退了。……