一、瑜只经，谓金刚界遍照如来是自性身。
二、分别圣位经谓有二种之受用身，卢遮那是二受用身也。
三、摄真实经言毗卢遮那示现化身至释迦菩提道场。又义诀言龙树先持诵毗卢遮那真言。感得现真身为说持念法，是变化身。
四、略出经言毗卢遮那来天等之会者，是等流身。见菩提心义十。
大日如来系密宗将宇宙实相佛格化之根本佛，亦为一切诸佛菩萨所出之本原及所归之果体；其身口意业遍虚空，演说如来之三密门金刚一乘甚深教。大日经疏卷一谓，大日如来分本地法身与加持受用身两种，其中，本地法身指如来之自证极位，加持受用身指说法之教主；彼以平等之身口意秘密加持为所入之门（即以身平等之密印、语平等之真言、心平等之妙观为方便），故知加持受用之身即是毗卢遮那遍一切身，此二身毕竟无二无别。故密宗以大日如来为最高之佛格与根本总德。以其与诸法遍在，故密号遍照金刚。
又因大日如来为金、胎两部曼荼罗之主尊，故非常被重视，其智德以金刚界大日如来表示之，其理德则以胎藏界大日如来表示；理、智虽然二分，实际亦不相离。金刚界大日为金刚界九会中，除理趣会以外之中尊，位于五佛中央，现菩萨形，身呈白色，戴五智宝冠，结智拳印，结跏趺坐于七狮子座，此即智法身，种子为徤（vam!），三昧耶形为率都婆；胎藏界。
大日则为位于中台八叶院中央之理法身，亦现菩萨形，身呈黄金色，头戴五佛宝冠，结法界定印，坐于八叶莲华台上，种子为“阿”（a），三昧耶形为窣都婆或如来顶印。
现存之大日如来像，不论绘画或雕刻，均为坐像，没有立像或倚像，且其雕刻材料几乎限用木材，此乃依此佛之性质而定。又天台宗每将释迦佛与大日如来之法身、应身视为同体，日本东密则将两者视为别体。
金刚界曼荼罗和胎藏界曼荼罗都以大日如来为主尊，但大日如来的形像和姿态在这两部曼荼罗中略有不同。
金刚界
金刚界大日如来，象徵摧坏众生烦恼，把降伏烦恼的智慧比喻为“金刚“，表示其坚固不坏，代表着如来智慧的世界。《金刚顶经义诀》卷上说：此如来又名“佛菩萨眼如来“，亦名“诸佛菩萨母“，亦名“诸佛菩萨最上广博清净藏“。一切诸佛菩萨因此而得以明见，于中出生，一切贤圣于中安住，故有此名。
“大日如来“在金刚界中，密号“遍照金刚“、“无障金刚“，在一印会、四印会及成身会中，皆身呈白肉色，具足三十二相八十种好，手结智拳印，头戴五佛宝冠，着妙天衣。
大日如来为金刚界曼荼罗五大月轮中央轮五尊之中尊，位于色界顶摩醯首罗宫（即大自在宫与胎藏大日依处同），不坏金刚光明心殿中，五相圆满，始成正觉之相，显修生智德之智法身也，其相似菩萨，作天人之状，跏趺坐，头垂发，戴五智之宝冠，上半身戴着手镯、臂钏、璎珞等装饰品，手结智拳印，即左手食指伸直，用右手的手掌把它握住，通身之色清白，以“鑁”（vam）字为种子字，以五股杵为三昧耶形，密号谓之遍照金刚。
圣位经曰：‘尔时金刚界毗卢遮那佛在色界顶阿迦尼吒天宫，初受用身成等正觉证得一切如来平等。’略出经三曰：‘由结大智拳印契故能入佛智。（中略）结跏趺坐有大威德，色如白鹅，形如净月，一切相好悉皆圆满显具，宝冠垂发以缯彩轻妙天衣绕腰被绁而为上服。’秘藏记上曰：‘鍐字者，智法身种子。’瑜只经疏曰：‘以鑁字为大日种子。’瑜只经曰：‘薄伽梵遍照如来。’秘藏记钞三曰：‘金刚界者以五股杵为体，五股杵表五智，即大日三昧耶形也。’